海南申请高新技术企业的具体流程如下：
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1. 企业准备材料：
企业营业执照副本复印件；
法定代表人身份证明；
企业章程复印件；
近三年财务审计报告；
企业研发活动证明材料，如研发费用投入、研发人员数量、研发成果等；
企业知识产权证明材料，如专利证书、软件著作权等；
企业高新技术产品（服务）证明材料；
企业高新技术领域证明材料；
企业高新技术研发机构证明材料；
企业其他相关证明材料。
2. 企业自主申报：
企业登录海南省高新技术企业认定管理系统进行申报；
按照系统要求填写企业基本信息、研发活动、知识产权、科技成果转化、高新技术产品（服务）等申报内容；
上传相关证明材料。
3. 地方科技部门审核：
县级以上科技部门对企业的申报材料进行审核；
对申报材料不符合要求的企业，要求其补充或修改材料。
4. 省级科技部门复核：
省级科技部门对地方科技部门审核通过的企业进行复核；
复核通过的企业，由省级科技部门公示。
5. 公示与异议处理：
公示期为5个工作日；
对公示有异议的，由省级科技部门进行调查核实。
6. 颁发证书：
公示无异议的企业，由省级科技部门颁发《高新技术企业证书》。
7. 后续管理：
企业需按照相关规定进行年度报告、研发费用归集等管理工作；
如企业不符合高新技术企业条件，需及时办理注销手续。
请注意，以上流程仅供参考，具体操作时请以当地科技部门发布的最新政策为准。
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