辽宁大学和沈阳药科大学都是中国知名的高等学府，在各自的领域内都有较高的声誉。
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沈阳药科大学是中国最早的高等药科院校之一，其制药工程专业历史悠久，教学资源和科研实力都非常强。沈阳药科大学在制药工程领域享有很高的声誉，特别是在药物制剂、制药工艺等方面有较强的研究实力。
辽宁大学虽然不是以制药工程著称，但作为综合性大学，其制药工程专业同样有着良好的教学和研究条件。辽宁大学在化学、生物学等相关学科也有较强的研究基础，这为制药工程专业的学生提供了广阔的学习和研究平台。
综合来看，如果从专业特色和行业认可度来看，沈阳药科大学的制药工程专业可能更具有优势。但如果考虑综合性大学的教育资源和学科交叉优势，辽宁大学也是一个不错的选择。
最终的选择应根据个人的兴趣、职业规划以及对未来职业发展的期望来决定。建议您根据自己的实际情况，对比两校的师资力量、课程设置、实验条件、就业情况等多方面因素，做出最适合自己的选择。
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