在PKPM（中国建筑科学研究院开发的结构设计软件）建模过程中，如果发现两个节点的坐标相差50，这可能是由于以下原因造成的：
1. 数据输入错误：在录入节点坐标时，可能因为输入错误导致坐标偏差。
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2. 模型精度问题：在某些情况下，节点的精度设置可能导致计算结果出现偏差。
3. 网格划分问题：网格划分不均匀或者过于密集也可能导致节点位置出现较大偏差。
以下是一些解决方法：
1. 数据检查
重新检查输入数据：仔细核对输入的节点坐标，确保没有错误。
校对图纸：与设计图纸进行比对，确认坐标是否符合设计要求。
2. 调整模型精度
调整网格划分：检查网格划分是否均匀，必要时进行调整。
调整节点精度：在PKPM中，可以设置节点的精度，调整精度设置可能会减少偏差。
3. 模型调整
移动节点：如果偏差是由于节点位置错误造成的，可以直接在模型中移动节点。
调整整体模型：有时，通过调整整个模型的位置（例如整体平移）可以减少节点之间的偏差。
4. 软件设置
检查软件设置：确保软件设置正确，例如单位、坐标系统等。
5. 咨询专业人士
寻求帮助：如果问题复杂，可以咨询软件使用手册或联系软件的技术支持。
6. 保存备份
保存备份：在进行任何调整之前，先保存模型备份，以防万一调整后出现问题可以恢复。
通过上述方法，通常可以解决节点坐标相差较大的问题。如果问题仍然存在，可能需要进一步检查模型或寻求专业帮助。
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